高通量单细胞分析系统主要用于对悬浮液中的细胞或颗粒进行高速、多参数的定量分析。它通过将单个细胞依次流过激光检测点，同时收集细胞散射光及荧光信号，从而快速获取海量细胞群的物理属性（大小、复杂度）和生化特征（如表面标志物、胞内蛋白表达）。核心用途是鉴定和量化复杂样本中的不同细胞亚群，例如分析血液中各类免疫细胞的比例与功能状态。